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    Histórico  
     
  O delineamento das ecorregiões aquáticas brasileiras teve como ponto de partida o estudo " A Collaborative Approach to Understanding Regional Patterns of Freshwater Biodiversity in Latin América: a Framework for Setting Priorities ", elaborado sob os auspícios das organizações não governamentais The Nature Conservancy (TNC) e World Wildlife Fund (WWF). Neste estudo foram consideradas, como fonte primária de riqueza biótica e informação distintiva para delineamento das unidades, a distribuição geográfica de peixes, bem como riqueza de espécies, endemismo e aspectos de sua história natural e ecologia. As fontes primárias de informação foram revisões sistemáticas publicadas e não publicadas.

A composição taxonômica da ictiofauna, estimativas de riqueza de espécies e taxas de endemismo das ecorregiões foram extraídas de literatura primária assim como de base de dados digital compilada a partir de informações contidas na publicação " Check List of Freshwater Fishes of South and Central América". Neste trabalho foi gerado também um Sistema de Informações, composto por características da paisagem, mapas de relevo, geomorfologia, hidrografia e clima. Para consolidar o delineamento das ecorregiões aquáticas brasileiras, o Fundo Setorial do Ministério da Ciência e Tecnologia - CT Hidro/MCT, em conjunto com a Secretaria de Recursos Hídricos do Ministério do Meio Ambiente (SRH/MMA), promoveu oficina de trabalho nos dias 4 e 5 de abril de 2005, com a presença de especialistas em biogeografia de organismos aquáticos e Limnologia. Como resultado desta oficina foi gerado o "mapa das ecorregiões aquáticas brasileiras", em escala 1: 1.000.000, tendo sido identificadas 25 ecorregiões aquáticas: Rio Branco; Rio Negro; Escudo das Guianas; Planície Amazônica; Estuário do Amazonas ; XINGU - TAPAJÓS; Margem Direita do Rio Madeira; Guaporé; Gurupi e Golfão Maranhense; Tocantins - Araguaia ; Maranhão - Piauí ; São Francisco; Mata Atlântica ; Caatinga e Costa Nordeste Central ; Paraguai - Pantanal ; Alto Paraná ; Iguaçu; Alto Uruguai; Baixo Uruguai ; Paraíba do Sul ; Fluminense ; Ribeira do Iguape; Costa Sul Brasileira; Tramandaí - Mampituba ; Lagoa dos Patos.

Utilizando como critérios o grau de endemismo, espécies ameaçadas, grau de ameaça à integridade do ecossistema (pressões antrópicas), interesse biogeográfico, grau de conhecimento sobre os meios biológico e físico, dentre outros, foram selecionadas cinco áreas piloto (Xingu - Tapajós, Paraguai - Pantanal, Costa Sudeste Brasileira, Iguaçu e Mata Atlântica) para realização de estudos mais detalhados e definição de unidades biogeográficas na escala 1:250. 000, correspondentes a sistemas ecológicos, por meio de edital do CNPq (Edital CT-Hidro/MCT/CNPq nº37/2005). Dos projetos apresentados foram selecionados quatro, correspondentes às ecorregiões Xingu - Tapajós, Paraguai - Pantanal, Costa Sudeste Brasileira, e Bacia do Iguaçu para a formação de uma rede de pesquisa.
 
   
   
 
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